More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0039 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00654  potassium-transporting ATPase subunit B  69.87 
 
 
682 aa  910    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2939  K+-transporting ATPase, B subunit  69.87 
 
 
682 aa  912    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489024  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0709  K+-transporting ATPase, B subunit  60.11 
 
 
678 aa  775    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0895  K+-transporting ATPase, B subunit  62.39 
 
 
700 aa  853    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00141926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2481  potassium-transporting ATPase, B subunit  58.62 
 
 
689 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1247  potassium-transporting ATPase subunit B  72.83 
 
 
689 aa  943    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437344  normal  0.920724 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1250  potassium-transporting ATPase subunit B  74.54 
 
 
695 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2486  potassium-transporting ATPase subunit B  52.65 
 
 
673 aa  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2216  K+-transporting ATPase, B subunit  71.43 
 
 
690 aa  952    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5359  potassium-transporting ATPase subunit B  62.59 
 
 
680 aa  779    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.803898  normal  0.0473609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3383  potassium-transporting ATPase subunit B  77.2 
 
 
744 aa  1055    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0810  potassium-transporting ATPase subunit B  56.73 
 
 
696 aa  755    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0401625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5923  K+-transporting ATPase, B subunit  72.61 
 
 
694 aa  930    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0723  potassium-transporting ATPase subunit B  69.87 
 
 
682 aa  910    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1242  potassium-transporting ATPase subunit B  74.3 
 
 
703 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2243  potassium-transporting ATPase, B subunit  61.55 
 
 
692 aa  789    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0704  potassium-transporting ATPase subunit B  56.02 
 
 
697 aa  748    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3639  potassium-transporting ATPase subunit B  61.78 
 
 
690 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0648  potassium-transporting ATPase subunit B  56.37 
 
 
697 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00492654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3238  K+-transporting ATPase, B subunit  63.16 
 
 
697 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369996  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0647  potassium-transporting ATPase subunit B  56.45 
 
 
697 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0218821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0625  potassium-transporting ATPase subunit B  56.35 
 
 
698 aa  750    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0032886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1875  potassium-transporting ATPase subunit B  74.4 
 
 
695 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2048  potassium-transporting ATPase subunit B  61.69 
 
 
692 aa  786    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440524  normal  0.433607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1086  potassium-transporting ATPase subunit B  72.39 
 
 
688 aa  966    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0507083  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0700  potassium-transporting ATPase subunit B  54.43 
 
 
681 aa  728    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2292  ATPase, E1-E2 type:potassium-translocating P-type ATPase, B subunit  81.33 
 
 
739 aa  1177    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1013  K+-transporting ATPase, B subunit  61.46 
 
 
705 aa  771    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.899135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6337  potassium-transporting ATPase subunit B  63.11 
 
 
705 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0407922 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0206  potassium-transporting ATPase subunit B  56.14 
 
 
715 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1194  potassium-transporting ATPase subunit B  56.18 
 
 
725 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3848  potassium-transporting ATPase subunit B  54.33 
 
 
708 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.935004  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0062  potassium-transporting ATPase subunit B  52.65 
 
 
673 aa  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2506  K+ transporting ATPase B chain  70.7 
 
 
699 aa  912    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1394  potassium-transporting ATPase subunit B  74.54 
 
 
719 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4032  potassium-transporting ATPase subunit B  61.46 
 
 
688 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1266  potassium-transporting P-type ATPase, B chain, KdpB  59.75 
 
 
675 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2924  K+-transporting ATPase, B subunit  59.6 
 
 
675 aa  760    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149598  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5614  potassium-transporting ATPase subunit B  73.65 
 
 
694 aa  999    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00425653  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0449  potassium-transporting ATPase subunit B  73.12 
 
 
717 aa  967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.404927  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2381  potassium-translocating P-type ATPase, B subunit  69.86 
 
 
694 aa  895    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559168  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2434  potassium-translocating P-type ATPase, B subunit  57.75 
 
 
689 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0377126  normal  0.896265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0060  potassium-transporting ATPase subunit B  52.65 
 
 
673 aa  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0740  potassium-transporting ATPase subunit B  56.02 
 
 
696 aa  748    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000701249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3713  potassium-transporting ATPase subunit B  58.76 
 
 
674 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1669  potassium-transporting ATPase subunit B  57.3 
 
 
696 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1156  potassium-translocating P-type ATPase B subunit  63.99 
 
 
682 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230345  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3783  hypothetical protein  62.04 
 
 
670 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.986648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3732  potassium-transporting ATPase subunit B  60.03 
 
 
684 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.351838  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1022  potassium-transporting ATPase subunit B  74.65 
 
 
703 aa  1006    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0894  potassium-translocating P-type ATPase, B subunit  67.51 
 
 
695 aa  893    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3286  potassium-transporting ATPase subunit B  62.75 
 
 
720 aa  808    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.049829  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4646  potassium-transporting ATPase subunit B  61.45 
 
 
689 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4549  potassium-transporting ATPase subunit B  61.7 
 
 
705 aa  812    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.863518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3251  potassium-transporting ATPase subunit B  75.28 
 
 
694 aa  1021    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333368  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1209  potassium-transporting ATPase subunit B  70.72 
 
 
682 aa  923    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.18705  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0663  potassium-transporting ATPase subunit B  62.08 
 
 
707 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2993  potassium-transporting ATPase subunit B  61.28 
 
 
689 aa  811    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0039  potassium-transporting ATPase subunit B  100 
 
 
743 aa  1481    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0511  potassium-translocating P-type ATPase, B subunit  65.86 
 
 
677 aa  866    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0601  potassium-transporting ATPase subunit B  61.35 
 
 
754 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1017  K+-transporting ATPase, B subunit  63.8 
 
 
700 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.771548  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0744  potassium-transporting ATPase subunit B  70.01 
 
 
682 aa  909    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2849  potassium-transporting ATPase subunit B  63.64 
 
 
678 aa  796    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0237758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11048  potassium-transporting ATPase subunit B  62.87 
 
 
709 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3777  potassium-transporting ATPase subunit B  64.02 
 
 
684 aa  830    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0591434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0367  potassium-transporting ATPase subunit B  73.97 
 
 
692 aa  988    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1675  potassium-transporting ATPase subunit B  73.23 
 
 
694 aa  994    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4605  potassium-transporting ATPase subunit B  60.74 
 
 
713 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4227  potassium-transporting ATPase subunit B  60.74 
 
 
713 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.465441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2113  potassium-transporting ATPase subunit B  53.21 
 
 
675 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.96007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0783  potassium-transporting ATPase subunit B  74.4 
 
 
695 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.700575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1983  potassium-transporting ATPase, subunit B  55.87 
 
 
670 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0203328  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0444  K+-transporting ATPase, B subunit  63.77 
 
 
700 aa  854    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.798455  normal  0.81357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1211  potassium-transporting ATPase subunit B  60.54 
 
 
688 aa  833    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1467  K+-transporting ATPase, B subunit  60.94 
 
 
676 aa  743    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13547  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2325  potassium-transporting ATPase subunit B  73.28 
 
 
703 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0991  potassium-transporting ATPase subunit B  73.51 
 
 
694 aa  996    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43380  potassium-transporting ATPase subunit B  61.64 
 
 
690 aa  782    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549048  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1876  K+-transporting ATPase, B subunit  56.62 
 
 
708 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2287  potassium-transporting ATPase subunit B  73.23 
 
 
694 aa  994    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2276  K+-transporting ATPase, B subunit  67.09 
 
 
697 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2619  K+-transporting ATPase, B subunit  57.67 
 
 
720 aa  741    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3081  K+-transporting ATPase, B subunit  53.93 
 
 
672 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2151  potassium-transporting ATPase subunit B  53.21 
 
 
675 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3581  potassium-transporting ATPase subunit B  71.67 
 
 
688 aa  937    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0655  potassium-transporting ATPase subunit B  56.88 
 
 
697 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1106  potassium-transporting ATPase subunit B  71.67 
 
 
688 aa  937    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3972  K+-transporting ATPase subunit B  53.55 
 
 
709 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315323  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3489  K+-transporting ATPase, B subunit  59.97 
 
 
678 aa  774    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.384037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1974  K+-transporting ATPase, B subunit  55.18 
 
 
685 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1669  potassium-transporting ATPase subunit B  72.79 
 
 
691 aa  964    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4293  potassium-transporting ATPase subunit B  60.74 
 
 
713 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4760  potassium-transporting ATPase subunit B  60.14 
 
 
714 aa  806    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425316  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0054  K+-transporting ATPase, B subunit  60.92 
 
 
678 aa  784    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0234  K+-transporting ATPase, B subunit  63 
 
 
696 aa  807    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0356  K+-transporting ATPase, B subunit  71.02 
 
 
710 aa  927    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0103902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3603  K+-transporting ATPase, B subunit  72.44 
 
 
692 aa  940    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556807  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1226  K+-transporting ATPase, B subunit  59.05 
 
 
688 aa  755    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1708  potassium-transporting ATPase subunit B  60.17 
 
 
684 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>