213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0035 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  69.5 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  57.65 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  56.14 
 
 		 267 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  56.18 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  56.58 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  56.58 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  56.58 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  56.58 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  56.23 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  56.23 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  55.87 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  55.87 
 
 		 257 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  54.45 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  54.09 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  54.45 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  53.52 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  53.66 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  53.33 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3364  septum formation inhibitor  52.48 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  41.73 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  39.36 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  37.23 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  37.23 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  70.09 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  67.29 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  39.07 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  37.55 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  56.03 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  65.42 
 
 		 257 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  37.68 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  34.66 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  34.55 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  57.27 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  33.94 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2302  septum site-determining protein MinC  60.19 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  33.21 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  34.04 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  42.86 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  33.21 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2036  septum site-determining protein MinC  55.86 
 
 		 258 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  32.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  32.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  32.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  32.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  32.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3508  septum formation inhibitor  35.25 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0612972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  46.05 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  33.33 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  35.4 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  33.33 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  31.47 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  51.4 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  54.63 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  42.42 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  54.72 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  31.82 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  31.32 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  33.94 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  52.34 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  51.85 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  51.85 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  31.58 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  51.85 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  52.34 
 
 		 236 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  52.34 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  52.34 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  41.67 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  55.34 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  52.34 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  54.21 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  52.34 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  31.67 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  49.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  49.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  49.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  52.34 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  48 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  30.36 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  50.43 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  49.57 
 
 		 228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  34.14 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  30.55 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  52.43 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  50.45 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  32.74 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  50 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  47.62 
 
 		 220 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  45.74 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  49.52 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  45.95 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  50.43 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  34.35 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  50.49 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  50.98 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  32.93 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  35.14 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>