More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0030 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  86.73 
 
 		 98 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  86.73 
 
 		 98 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  66.33 
 
 		 99 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  66.33 
 
 		 99 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  71.74 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  67.71 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  70.97 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  62.5 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  59.8 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  59.8 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  59.8 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  58.82 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  58.82 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  68.83 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  66.23 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  56.32 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  56.1 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  56.1 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  56.1 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  56.1 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  51.09 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  60 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  46.94 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  45.26 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  47.87 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  47.87 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  47.87 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  44.9 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  43.3 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  43.3 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  43.3 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  42.42 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>