More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0010 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0010  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 345 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  61.36 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  59.41 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3228  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3314  ABC transporter related  60.24 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.761425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1662  ABC transporter related  56.8 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  46.4 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  46.4 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  41.87 
 
 		 370 aa  298  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  46.13 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.96 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  44.77 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  46.22 
 
 		 345 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  46.05 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  43.28 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  55.79 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  56.2 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  49.32 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  57.44 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  42.25 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.96 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  49.36 
 
 		 403 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.96 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  43.61 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.53 
 
 		 364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  42.45 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  44.75 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.68 
 
 		 357 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  43.01 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  51.3 
 
 		 369 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  55.37 
 
 		 372 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 357 aa  282  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  42.63 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  43.85 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  47.44 
 
 		 355 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.81 
 
 		 363 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  43.1 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.9 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.39 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  54.1 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  41.27 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  47.08 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  47.47 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  43.82 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  55.19 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  43.24 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  43.56 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 		 436 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.77 
 
 		 360 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  42.55 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  43.17 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  54.29 
 
 		 367 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  42.66 
 
 		 364 aa  278  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  54.29 
 
 		 367 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 406 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  41.69 
 
 		 353 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.52 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  55.14 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  42.32 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.91 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.32 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.18 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  46.95 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  42.74 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  41.53 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  47.78 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  40.87 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  44.05 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  41.76 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.64 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.09 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  41.42 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  41.76 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>