More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0006 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.53 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.53 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  66.43 
 
 		 287 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.29 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.76 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  57.73 
 
 		 296 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.49 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  57.59 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  50.49 
 
 		 319 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  54.55 
 
 		 319 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  54.9 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 301 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  53.87 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  53.87 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  53.87 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  53.52 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  53.98 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  53.29 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  53.63 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  52.1 
 
 		 236 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  53.07 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.06 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  33.89 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  33.45 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  33.89 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  32.21 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  37.41 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  33.67 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  31.37 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  31.05 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  31.05 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  31.05 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  31.53 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.85 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.79 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  31.51 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.09 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  27.95 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.18 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  29.9 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  27.59 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.81 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  31.36 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.18 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  30.32 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.97 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.11 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  32.26 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.28 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  27.62 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.03 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  27.81 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.11 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.43 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.82 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.1 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.17 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  29.07 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  31.18 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  26.4 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  26.95 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.74 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  27.53 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.13 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  23.2 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.65 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.31 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.26 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.88 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.88 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.88 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.72 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.88 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.88 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.88 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.72 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  32.17 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>