216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2913 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
553 aa  1137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  45.52 
 
 
550 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  48.82 
 
 
570 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  46.86 
 
 
594 aa  508  1e-142  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  45.33 
 
 
598 aa  506  1e-142  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  47.03 
 
 
559 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  41.41 
 
 
580 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.68 
 
 
545 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.81 
 
 
544 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  33.46 
 
 
558 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  40.43 
 
 
326 aa  230  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  32.67 
 
 
525 aa  222  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  38.2 
 
 
325 aa  216  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  1.23897e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  38.2 
 
 
325 aa  215  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  37.14 
 
 
325 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.8 
 
 
343 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  38.23 
 
 
325 aa  202  1e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  37.05 
 
 
339 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.69 
 
 
339 aa  201  4e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  34.5 
 
 
334 aa  199  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  36.45 
 
 
339 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.39 
 
 
344 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.28 
 
 
342 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.28 
 
 
339 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  35.95 
 
 
333 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17029e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.37 
 
 
338 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  36.2 
 
 
346 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.65 
 
 
333 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 
330 aa  191  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.53 
 
 
350 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  35.1 
 
 
344 aa  190  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.24 
 
 
343 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.48 
 
 
339 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.63 
 
 
731 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  35.44 
 
 
346 aa  185  2e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  34.74 
 
 
344 aa  184  4e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  34.64 
 
 
343 aa  184  5e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.22 
 
 
342 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  37.43 
 
 
344 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.76 
 
 
341 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  32.74 
 
 
731 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.61 
 
 
334 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.69 
 
 
344 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 
331 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.94 
 
 
343 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.42 
 
 
336 aa  174  3e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 
727 aa  174  3e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  34.04 
 
 
343 aa  174  4e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  37.85 
 
 
329 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
343 aa  173  6e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  33.04 
 
 
343 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  34.63 
 
 
346 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  32.44 
 
 
343 aa  171  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 
347 aa  170  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.12 
 
 
332 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.86 
 
 
336 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.71 
 
 
343 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.24 
 
 
350 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.04 
 
 
344 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  34.55 
 
 
343 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 
347 aa  164  4e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  34.23 
 
 
344 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  35.84 
 
 
343 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.71 
 
 
343 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  32.22 
 
 
342 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  33.73 
 
 
343 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.15 
 
 
332 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
343 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 
344 aa  157  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  39.32 
 
 
333 aa  147  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  32.22 
 
 
691 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 
330 aa  144  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  27.5 
 
 
331 aa  142  2e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  29.81 
 
 
330 aa  140  8e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.08 
 
 
330 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 
330 aa  138  3e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.4 
 
 
331 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
333 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 
330 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.25 
 
 
330 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  25.69 
 
 
330 aa  133  7e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.47044e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.79 
 
 
330 aa  133  8e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.8 
 
 
331 aa  132  2e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 
331 aa  130  7e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  27.19 
 
 
331 aa  129  2e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 
331 aa  127  4e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  36.22 
 
 
207 aa  126  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27.55 
 
 
333 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  27.33 
 
 
331 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  26.79 
 
 
326 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  22.47 
 
 
326 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 
330 aa  124  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  32.56 
 
 
371 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 
331 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.09 
 
 
336 aa  123  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 
333 aa  122  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 
319 aa  122  2e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  25.93 
 
 
330 aa  121  4e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 
306 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28.95 
 
 
337 aa  120  8e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>