69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2821 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  100 
 
 
474 aa  951  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  36.9 
 
 
461 aa  328  2e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  40.34 
 
 
470 aa  327  2e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  39.6 
 
 
460 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  34.05 
 
 
462 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  39.87 
 
 
464 aa  295  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  32.54 
 
 
463 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  34.96 
 
 
464 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  40.04 
 
 
463 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  39.53 
 
 
496 aa  282  8e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  36.56 
 
 
463 aa  266  9e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  34.9 
 
 
450 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  36.66 
 
 
473 aa  263  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  34.81 
 
 
460 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.53 
 
 
469 aa  259  5e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  37.62 
 
 
464 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  38 
 
 
458 aa  257  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  34.5 
 
 
463 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  33.26 
 
 
471 aa  246  7e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  31.8 
 
 
457 aa  245  2e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  37.97 
 
 
443 aa  244  2e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  36.45 
 
 
456 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  35.27 
 
 
431 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  34.38 
 
 
457 aa  225  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.4 
 
 
420 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  29.42 
 
 
454 aa  216  6e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  31.5 
 
 
469 aa  197  4e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  32.43 
 
 
462 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  36.13 
 
 
439 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.69 
 
 
509 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.47633e-05  hitchhiker  2.37286e-08 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  36.77 
 
 
439 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  30.61 
 
 
478 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  27.48 
 
 
456 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  25.1 
 
 
456 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  33.33 
 
 
487 aa  154  3e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  26 
 
 
456 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  28.85 
 
 
472 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  30.32 
 
 
472 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  29.37 
 
 
470 aa  128  2e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  29.45 
 
 
475 aa  128  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.65 
 
 
498 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  28.16 
 
 
476 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.78 
 
 
474 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  26.54 
 
 
485 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  30.1 
 
 
454 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  25.96 
 
 
480 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  27.93 
 
 
501 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  27.56 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  27.57 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  24.54 
 
 
313 aa  72.8  1e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  23.08 
 
 
304 aa  68.6  3e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  28.4 
 
 
307 aa  64.7  4e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  25.48 
 
 
283 aa  63.9  7e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  27.39 
 
 
277 aa  62  2e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  25.58 
 
 
261 aa  62  2e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  20.8 
 
 
304 aa  55.5  2e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  24.68 
 
 
279 aa  52  2e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  25.41 
 
 
377 aa  51.6  3e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.72 
 
 
393 aa  50.8  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  24.21 
 
 
356 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  26.91 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  22.29 
 
 
844 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  26.37 
 
 
916 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  25 
 
 
364 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  23.16 
 
 
374 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 
1188 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.59 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  22.11 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>