176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2797 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.05 
 
 		 852 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.38 
 
 		 868 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.81 
 
 		 866 aa  718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.04 
 
 		 863 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 858 aa  1724    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.88 
 
 		 857 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 		 884 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.91 
 
 		 888 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  35.13 
 
 		 896 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.37 
 
 		 888 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.06 
 
 		 896 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.98 
 
 		 896 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.55 
 
 		 888 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  35.04 
 
 		 889 aa  436  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.48 
 
 		 885 aa  436  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 		 935 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.86 
 
 		 906 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.58 
 
 		 919 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  35.2 
 
 		 891 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 		 891 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  34.56 
 
 		 883 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  33.59 
 
 		 881 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  34.53 
 
 		 883 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  34.58 
 
 		 883 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 		 900 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 		 853 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  33.88 
 
 		 879 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 		 932 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.59 
 
 		 935 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.99 
 
 		 932 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.66 
 
 		 913 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 		 913 aa  357  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.2 
 
 		 827 aa  356  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 		 910 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.96 
 
 		 915 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 		 828 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 		 837 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.37 
 
 		 837 aa  351  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 		 827 aa  346  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.49 
 
 		 827 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  34.53 
 
 		 833 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  34.49 
 
 		 856 aa  343  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  34.53 
 
 		 833 aa  343  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  34.53 
 
 		 833 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  34.16 
 
 		 836 aa  342  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 		 833 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 		 833 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 		 833 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  30.96 
 
 		 639 aa  300  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  31.36 
 
 		 637 aa  287  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  30.63 
 
 		 639 aa  287  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.45 
 
 		 834 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.2 
 
 		 602 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 		 613 aa  268  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 		 795 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.36 
 
 		 775 aa  263  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.06 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.38 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 		 760 aa  260  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 		 639 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.25 
 
 		 762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  31.56 
 
 		 777 aa  256  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.72 
 
 		 779 aa  255  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.99 
 
 		 779 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 		 634 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.46 
 
 		 774 aa  254  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 		 553 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.99 
 
 		 765 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.67 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.7 
 
 		 636 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.97 
 
 		 905 aa  244  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 		 618 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.71 
 
 		 639 aa  244  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 		 627 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 		 534 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 		 785 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  30.29 
 
 		 795 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 		 655 aa  237  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.24 
 
 		 636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  31.6 
 
 		 736 aa  235  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.73 
 
 		 673 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.74 
 
 		 613 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.74 
 
 		 609 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.88 
 
 		 790 aa  230  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.83 
 
 		 766 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.92 
 
 		 781 aa  227  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 		 505 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  28.24 
 
 		 776 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.15 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 		 533 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 		 527 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.01 
 
 		 673 aa  217  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.88 
 
 		 812 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 		 529 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.03 
 
 		 812 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.62 
 
 		 614 aa  213  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 		 821 aa  212  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 		 772 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>