More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2764 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  2.20689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  54.01 
 
 
288 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  52.96 
 
 
288 aa  272  5e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  47.08 
 
 
292 aa  269  4e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  51.21 
 
 
289 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1380  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  46.85 
 
 
292 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.860557  normal  0.37299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  47.92 
 
 
290 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2097  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  44.6 
 
 
284 aa  234  1e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  49.31 
 
 
287 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  46.18 
 
 
284 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  46.6 
 
 
289 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  43.71 
 
 
283 aa  233  4e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2041  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.1 
 
 
292 aa  214  1e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  43.82 
 
 
285 aa  214  1e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.01 
 
 
278 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.46 
 
 
286 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.26 
 
 
288 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  43.11 
 
 
285 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0841  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.21 
 
 
288 aa  200  2e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  hitchhiker  3.81307e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3968  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  41.72 
 
 
284 aa  199  4e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.36 
 
 
286 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1638  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  42.71 
 
 
295 aa  198  1e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.921721  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.61 
 
 
278 aa  195  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5284  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.95 
 
 
290 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0342  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.32 
 
 
288 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.461873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4146  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.64 
 
 
288 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  40 
 
 
300 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.21172e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0489  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  41.16 
 
 
291 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0500  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  41.16 
 
 
291 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0478  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  41.16 
 
 
291 aa  190  3e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.76 
 
 
290 aa  189  6e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203771  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0228  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.75 
 
 
291 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1871  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  38.95 
 
 
287 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00397526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13130  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  43.73 
 
 
284 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.75 
 
 
306 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3025  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  44.24 
 
 
291 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0222  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.86 
 
 
292 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20080  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  41.32 
 
 
272 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0549265  hitchhiker  0.0021832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.67 
 
 
287 aa  181  9e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.09 
 
 
282 aa  179  5e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3094  carbon-monoxide dehydrogenase  39.79 
 
 
286 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0607  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.71 
 
 
295 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20900  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM-like protein  34.95 
 
 
294 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.25 
 
 
289 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.21 
 
 
272 aa  173  3e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0889  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  39.44 
 
 
271 aa  172  4e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.58 
 
 
278 aa  173  4e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4663  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.93 
 
 
276 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.91 
 
 
291 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.73 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.6 
 
 
283 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2230  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.11 
 
 
291 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6669  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.26 
 
 
289 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3104  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.57 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0450134  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  36.51 
 
 
286 aa  167  3e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  39.24 
 
 
280 aa  166  3e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1568  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.79 
 
 
269 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.623716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0076  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  35.46 
 
 
286 aa  164  1e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1946  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.59 
 
 
263 aa  164  2e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00353773  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4724  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.99 
 
 
287 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0928785  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5357  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.74 
 
 
285 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1218  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  37.63 
 
 
296 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1571  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.3 
 
 
300 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118942  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4985  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.14 
 
 
296 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.78 
 
 
285 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.36 
 
 
277 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.64 
 
 
292 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4690  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  35.79 
 
 
296 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4602  carbon-monoxide dehydrogenase  35.79 
 
 
296 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1784  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.71 
 
 
272 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1871  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.56 
 
 
282 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.67 
 
 
292 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.36 
 
 
288 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.09 
 
 
292 aa  152  6e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.939597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1291  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.09 
 
 
292 aa  152  9e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5854  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.92 
 
 
290 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.74 
 
 
270 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.93 
 
 
273 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.64 
 
 
305 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2635  carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  34.45 
 
 
300 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.33 
 
 
288 aa  148  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0171  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.81 
 
 
291 aa  148  1e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0379  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.89 
 
 
299 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3561  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.07 
 
 
292 aa  146  4e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.67 
 
 
461 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4548  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.38 
 
 
278 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2587  molybdopterin dehydrogenase  36.88 
 
 
287 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.551287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0669  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.8 
 
 
272 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5185  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.38 
 
 
297 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4325  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.46 
 
 
268 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1302  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.99 
 
 
279 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.27918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2204  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.04 
 
 
268 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765762  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2250  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.79 
 
 
263 aa  141  1e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.158246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3791  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.19 
 
 
275 aa  141  1e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1595  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.36 
 
 
263 aa  141  1e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2698  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  44.04 
 
 
275 aa  141  1e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0195145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  35.44 
 
 
294 aa  142  1e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1783  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.75 
 
 
268 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1467  oxidoreductase protein  35.82 
 
 
268 aa  140  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1489  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.79 
 
 
280 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>