More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2708 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
327 aa  644  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.15 
 
 
301 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0908  hypothetical protein  45.45 
 
 
310 aa  256  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
291 aa  255  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0573  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
311 aa  254  1e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 
304 aa  254  1e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3333  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
301 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1803  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.28 
 
 
302 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.72 
 
 
311 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.96 
 
 
313 aa  245  7e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4428  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.97 
 
 
301 aa  245  7e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.4 
 
 
313 aa  245  7e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.18 
 
 
283 aa  245  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.15 
 
 
316 aa  244  2e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
349 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  2.21131e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2748  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.07 
 
 
298 aa  242  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.14 
 
 
313 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.01 
 
 
294 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06555  S-adenosyl-methyltransferase mraW  43.28 
 
 
298 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3558  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
313 aa  239  6e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.85 
 
 
311 aa  239  6e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.21 
 
 
313 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
307 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.69 
 
 
294 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.442575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2099  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
324 aa  238  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.788894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.03 
 
 
311 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1339  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3533  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.21 
 
 
312 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  5.44385e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  43.18 
 
 
349 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  4.42175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3553  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2559  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2201  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.11 
 
 
317 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379608  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3224  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
349 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  6.42562e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.17 
 
 
316 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.96 
 
 
318 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
319 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
313 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2530  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.99 
 
 
332 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  49.04 
 
 
311 aa  236  5e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
312 aa  236  5e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
313 aa  234  1e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
313 aa  234  1e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
313 aa  234  1e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.14721e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
313 aa  234  1e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.69 
 
 
333 aa  234  1e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 
313 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
315 aa  233  2e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.03 
 
 
361 aa  234  2e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 
313 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3523  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
305 aa  234  2e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.550375  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
304 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.6 
 
 
313 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.14 
 
 
313 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.6 
 
 
313 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.95 
 
 
353 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.8 
 
 
322 aa  232  7e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
321 aa  232  7e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
311 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
319 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.37 
 
 
303 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.44 
 
 
305 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  3.74346e-06 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  48.73 
 
 
331 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.6 
 
 
313 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
294 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1500  methyltransferase  49.36 
 
 
312 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.2 
 
 
313 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
339 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.28 
 
 
313 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
310 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.69 
 
 
313 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
334 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.07 
 
 
337 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
310 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.61 
 
 
302 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0277587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>