More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2706 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
689 aa  1363    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  34.15 
 
 
695 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  36.94 
 
 
708 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.6 
 
 
657 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
670 aa  349  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.63 
 
 
657 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
657 aa  347  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.17 
 
 
660 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
662 aa  343  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 
654 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 
680 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.99 
 
 
711 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  34.75 
 
 
656 aa  333  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
723 aa  332  9e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
705 aa  326  7e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  34.25 
 
 
673 aa  326  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.71 
 
 
713 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 
582 aa  324  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 
684 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  36.2 
 
 
622 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
649 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 
638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 
673 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
680 aa  312  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  29.77 
 
 
728 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
704 aa  311  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 
657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 
570 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  29.91 
 
 
721 aa  311  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
613 aa  310  8e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 
553 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  38.73 
 
 
653 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.72 
 
 
682 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 
645 aa  299  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  35.1 
 
 
644 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
729 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  30.04 
 
 
727 aa  298  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  29.75 
 
 
727 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.16 
 
 
703 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
708 aa  296  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.5 
 
 
740 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 
631 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  32.64 
 
 
708 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
570 aa  291  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  33.7 
 
 
646 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.15 
 
 
553 aa  290  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.97 
 
 
553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  35.95 
 
 
579 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  35.28 
 
 
583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  34.66 
 
 
570 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  29.96 
 
 
719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  36 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  33.83 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  36.62 
 
 
645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  35.58 
 
 
579 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 
588 aa  283  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 
562 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
655 aa  283  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  29.01 
 
 
701 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  30.12 
 
 
662 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
571 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.65 
 
 
582 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  27.37 
 
 
734 aa  280  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 
692 aa  280  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 
672 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 
578 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
702 aa  277  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 
583 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  36.38 
 
 
575 aa  277  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  35.39 
 
 
577 aa  276  7e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
654 aa  276  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 
582 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  29.14 
 
 
739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  34.94 
 
 
575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  29.06 
 
 
704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 
675 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 
619 aa  275  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
582 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
580 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  32.78 
 
 
565 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  32.3 
 
 
565 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  33.7 
 
 
601 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  29.08 
 
 
739 aa  273  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.07 
 
 
552 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 
649 aa  272  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
577 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  32.86 
 
 
638 aa  272  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.07 
 
 
548 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  32.97 
 
 
597 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
586 aa  271  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>