25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2691 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
95 aa  193  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  31.08 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  27.96 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  29.35 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  25.27 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  28.95 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  28.74 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  26.37 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0645  hypothetical protein  26.67 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.361881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  28.42 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  26.97 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  24.18 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.72 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  29.03 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  30.59 
 
 
187 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  26.74 
 
 
266 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  26.88 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  24.44 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>