More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2622 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  47.33 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  47.45 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  47.31 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  46.15 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  46.69 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  46.69 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  47.08 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  46.85 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  44.49 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  46.54 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  45.21 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  44.83 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  42.69 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.9 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  46.95 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  47.33 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.68 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  45.28 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  45.45 
 
 		 259 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  41.47 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  47.29 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  42.31 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  46.12 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  47.29 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  43.3 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  44.79 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.64 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  43.68 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  37.83 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  45.66 
 
 		 294 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  46.77 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  43.68 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  45.31 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  37.83 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  46.01 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  49.42 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  43.73 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  41.92 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  43.48 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  42.58 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  45.28 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  45.45 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  47.31 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  46.43 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  45.53 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  40.7 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  43.98 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  46.39 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  45.28 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  43.89 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  45.96 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  43.75 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  45.95 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  44.7 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  41.79 
 
 		 268 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  43.13 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  43.75 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  40.31 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.63 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  41.9 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  42.97 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  42.32 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  43.48 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  41.25 
 
 		 260 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  40.15 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  42.58 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 322 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  42.15 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  42.97 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  43.14 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  43.97 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>