More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2603 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  47.2 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  47.54 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  45.9 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  44.16 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  44.13 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  47.27 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  47.66 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  42.51 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  46.67 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  43.3 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  42.35 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  43.2 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  45.35 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  43.35 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  44.57 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  42.57 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  42.57 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  40.16 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  42.25 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  44.62 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  42.13 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  40.31 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  39.76 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  41.61 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  39.82 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  40.71 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  45.82 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  40.71 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  42.35 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  41.96 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  41.5 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  45.7 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  44.76 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  40.16 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  42.79 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  41.92 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  43.29 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  43.36 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  44.64 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  44.64 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  43.48 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  42.31 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  43.48 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  42.48 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  44.25 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  42.73 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  42.92 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>