More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2511 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
316 aa  636    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  41.8 
 
 
311 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  37.76 
 
 
315 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.25 
 
 
315 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.54 
 
 
324 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  35.5 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.13 
 
 
301 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  38.21 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  36.71 
 
 
330 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.23 
 
 
294 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  38.39 
 
 
297 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  37.93 
 
 
298 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  40.06 
 
 
331 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  37.15 
 
 
333 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  38.41 
 
 
333 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0663  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
310 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.91 
 
 
325 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.34 
 
 
289 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.23 
 
 
307 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  38.02 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  37.15 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.43 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.45 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.45 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  36.57 
 
 
299 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.36 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.36 
 
 
335 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  39.05 
 
 
296 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  36.16 
 
 
299 aa  170  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.94 
 
 
324 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.25 
 
 
332 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  35.58 
 
 
373 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.52 
 
 
392 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  36.59 
 
 
333 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.74 
 
 
283 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  32.9 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  34.67 
 
 
326 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  34.42 
 
 
276 aa  166  6.9999999999999995e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.63 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  34.64 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.99 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  36.7 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35.6 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  37.89 
 
 
313 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.04 
 
 
334 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.56 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  37.42 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  35.67 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 
369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3707  chaperone DnaJ domain protein  37.7 
 
 
337 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.539813 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  35.2 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  31.92 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  34.42 
 
 
369 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.71 
 
 
287 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.19 
 
 
325 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.95 
 
 
297 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  31.84 
 
 
379 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  34.63 
 
 
340 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  33.44 
 
 
295 aa  160  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  37.39 
 
 
335 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  34.71 
 
 
297 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.45 
 
 
297 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  34.95 
 
 
304 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  34.92 
 
 
376 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  34.74 
 
 
298 aa  158  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  32.55 
 
 
341 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.56 
 
 
339 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  32.79 
 
 
386 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.09 
 
 
319 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  37 
 
 
318 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
324 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  33.62 
 
 
375 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  37.22 
 
 
386 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.75 
 
 
306 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.75 
 
 
306 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.75 
 
 
306 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.75 
 
 
306 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.75 
 
 
306 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  35.47 
 
 
370 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  35.02 
 
 
330 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.2 
 
 
306 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  34.46 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.2 
 
 
306 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.46 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.2 
 
 
306 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  35.71 
 
 
314 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.13 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0791  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.94 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000179186  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  34.34 
 
 
379 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.53 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.2 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.2 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.2 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.58 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  34.18 
 
 
333 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.2 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.2 
 
 
306 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  34.84 
 
 
309 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>