163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2477 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  997    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  62.85 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 489 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 489 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 495 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1379  glycyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 		 516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01740  glycyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 511 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 502 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 466 aa  528  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 443 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 478 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  48.65 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  48.65 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  46.15 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3146  glycyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>