19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2475 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  41.13 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  29.63 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  32.06 
 
 		 421 aa  96.3  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  27.17 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  24.89 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  31.08 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  24.36 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  25.65 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  22.86 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  30.74 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  24.28 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  25.71 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  26.15 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  25 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  31.48 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>