More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2447 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
505 aa  1033    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 
499 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 
512 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  43.49 
 
 
508 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  42.86 
 
 
516 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 
508 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 
508 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  42.77 
 
 
515 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  39.88 
 
 
496 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  39.27 
 
 
496 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  39.23 
 
 
496 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  39.88 
 
 
496 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 
501 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  44.56 
 
 
620 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  42.28 
 
 
501 aa  359  6e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 
509 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
513 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.31 
 
 
503 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 
491 aa  347  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 
520 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 
520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.49 
 
 
529 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 
517 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
527 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 
518 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 
528 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
496 aa  329  9e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.19 
 
 
512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.67 
 
 
517 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.67 
 
 
517 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.67 
 
 
517 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.26 
 
 
514 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 
490 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.98 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 
1043 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
525 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  37.83 
 
 
512 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
544 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  38.27 
 
 
503 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
525 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
533 aa  296  7e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
520 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 
510 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 
662 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 
510 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 
510 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 
510 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.49 
 
 
510 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 
510 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
516 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.49 
 
 
510 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.95 
 
 
510 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  38.83 
 
 
538 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
539 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 
510 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.86 
 
 
510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.49 
 
 
510 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.06 
 
 
482 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  34.77 
 
 
514 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  36.19 
 
 
532 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
495 aa  286  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
506 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1016  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0745502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 
550 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.86 
 
 
482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 
531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  36.69 
 
 
560 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
527 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  37.04 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 
587 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.19 
 
 
482 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 
492 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
530 aa  283  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  38.42 
 
 
540 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  38.42 
 
 
540 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.37 
 
 
481 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.66 
 
 
482 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.57 
 
 
481 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
530 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 
513 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  38.22 
 
 
540 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.66 
 
 
482 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.46 
 
 
482 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 
504 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
528 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
508 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  37.23 
 
 
546 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  36.56 
 
 
538 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
532 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.77 
 
 
481 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>