More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2431 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 		 601 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 632 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 609 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 598 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.33 
 
 		 602 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.17 
 
 		 599 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  57.64 
 
 		 615 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 606 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  54.03 
 
 		 600 aa  657    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 605 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  58.89 
 
 		 606 aa  716    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  55.23 
 
 		 629 aa  680    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  61.6 
 
 		 594 aa  735    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 607 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  60.17 
 
 		 650 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  52.86 
 
 		 622 aa  635    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  55.7 
 
 		 641 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 		 630 aa  678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 		 642 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  54.93 
 
 		 596 aa  636    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 609 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 		 602 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  52.53 
 
 		 602 aa  650    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  56.91 
 
 		 622 aa  685    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 		 602 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 600 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  57.64 
 
 		 615 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 598 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 614 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 		 630 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  57.17 
 
 		 627 aa  668    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 597 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  60 
 
 		 592 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  54.87 
 
 		 636 aa  660    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  57.64 
 
 		 615 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 620 aa  705    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 		 601 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 		 614 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 597 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 608 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 		 610 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  55.16 
 
 		 640 aa  651    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.9 
 
 		 605 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 614 aa  650    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.93 
 
 		 608 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  58.39 
 
 		 616 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  62.04 
 
 		 605 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 		 593 aa  658    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  53.95 
 
 		 608 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  57.45 
 
 		 613 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  53.05 
 
 		 614 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  59.54 
 
 		 616 aa  726    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  56.67 
 
 		 613 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 610 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 610 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  60.88 
 
 		 608 aa  755    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  56.37 
 
 		 613 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 		 633 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 602 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 		 603 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 608 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  55.86 
 
 		 613 aa  638    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 612 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 		 612 aa  668    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  54.69 
 
 		 642 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  60.79 
 
 		 594 aa  713    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 611 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 603 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.83 
 
 		 602 aa  656    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 601 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 605 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  56 
 
 		 631 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 607 aa  665    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.6 
 
 		 610 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 610 aa  688    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.86 
 
 		 600 aa  660    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 		 614 aa  715    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 		 613 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>