62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2315 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  35.53 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 146 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  34.22 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  37.28 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  33.52 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  32.79 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  35.88 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  34.48 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  30.41 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  31.47 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  34.27 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  26.8 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  26 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  35.2 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  35.2 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  33.79 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  31.72 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  26.79 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  27.5 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  27.17 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  28.97 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  29.5 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  29.5 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  26.63 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  29.08 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05846  hypothetical protein  27.1 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  22.54 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  23.7 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  28.78 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  24.44 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  24.44 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  24.43 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  25.28 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  29.5 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  23.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  23.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  23.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  28.87 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  23.31 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  25.14 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  26.2 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  23.66 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  27.14 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  19.46 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  23.49 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  23.13 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  27.1 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  23.95 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0625328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>