More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2297 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58 
 
 
150 aa  189  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.86 
 
 
158 aa  183  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.63 
 
 
158 aa  183  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.13 
 
 
183 aa  176  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  52 
 
 
157 aa  174  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  50.98 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.01 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  47.71 
 
 
159 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.71 
 
 
159 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 
155 aa  164  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.71 
 
 
160 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54 
 
 
161 aa  158  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.32 
 
 
159 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.69 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.31 
 
 
164 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  43.42 
 
 
154 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  55.06 
 
 
158 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.68 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  50.98 
 
 
186 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.45 
 
 
160 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.06 
 
 
157 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.52 
 
 
160 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.81 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.93 
 
 
223 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  44.22 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  52.35 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  44.81 
 
 
161 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
161 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  41.61 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.22 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  44.16 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.38 
 
 
211 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  46.38 
 
 
176 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
214 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  39.1 
 
 
149 aa  123  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.21 
 
 
157 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  35.98 
 
 
188 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.97 
 
 
161 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  42.45 
 
 
156 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  41.38 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  41.38 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  45.04 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  40.27 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  44.27 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.7 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.28 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.76 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.85 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.94 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  46.96 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.6 
 
 
190 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.83 
 
 
163 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.84 
 
 
152 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  47.02 
 
 
157 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.83 
 
 
147 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.44 
 
 
152 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.76 
 
 
190 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.04 
 
 
148 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.01 
 
 
190 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.59 
 
 
155 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.52 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.52 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  51.58 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.57 
 
 
301 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  43.81 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.95 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.54 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.51 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.6 
 
 
484 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.82 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.76 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  45.54 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.03 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.03 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.33 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  58.54 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  48.04 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.53 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.26 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  47.52 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.3 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.52 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.66 
 
 
146 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  48.42 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.32 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  43.93 
 
 
193 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  41.58 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  41.58 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.56 
 
 
176 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.2 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  50.57 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.51 
 
 
169 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.69 
 
 
158 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>