221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2267 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.16 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  50.6 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  50.55 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  53.16 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  53.85 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  53.85 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  53.66 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  44.09 
 
 		 382 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  53.16 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  52.56 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  51.28 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  42.17 
 
 		 360 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.42 
 
 		 373 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50 
 
 		 362 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  50 
 
 		 371 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  46.15 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  47.62 
 
 		 706 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.23 
 
 		 370 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.5 
 
 		 358 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  39.24 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  49.37 
 
 		 355 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  43.59 
 
 		 397 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  41.51 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.48 
 
 		 358 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  40.48 
 
 		 358 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  41.67 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1161  chorismate mutase  41.03 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  40.45 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1647  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.29 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.639332  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  37.21 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  43.62 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.14 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  43.14 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.78 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  44.68 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  45.88 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  44.94 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  44.68 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.18 
 
 		 371 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  36.04 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.04 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  41.41 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  44.58 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  39.02 
 
 		 366 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.11 
 
 		 359 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  46.84 
 
 		 363 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.18 
 
 		 371 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  37.08 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  37.11 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.57 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  41.03 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2533  Chorismate mutase  36.78 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  41.18 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  36.47 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40 
 
 		 365 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  40.2 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  34.29 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  41.18 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  40.2 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  41.18 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  46.75 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  44.3 
 
 		 361 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  36.59 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  40.2 
 
 		 364 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  38.75 
 
 		 362 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  46.75 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  43.68 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  42.7 
 
 		 391 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  45.45 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.74 
 
 		 359 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2732  chorismate mutase  33.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0378476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  41.77 
 
 		 362 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  38.89 
 
 		 355 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  36.26 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.96 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.16 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.08 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  34.04 
 
 		 365 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>