More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2256 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  34.85 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  38.66 
 
 
230 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  36.44 
 
 
222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  35.42 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  33.19 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  34.91 
 
 
228 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  33.77 
 
 
223 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0778  hypothetical protein  33.05 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  34.21 
 
 
238 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  33.48 
 
 
225 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  31.9 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  38.24 
 
 
241 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
227 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  34.89 
 
 
225 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  31.09 
 
 
236 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  33.06 
 
 
250 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  42.97 
 
 
235 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  32.74 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  27.54 
 
 
241 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  34.67 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  28 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  28.89 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  28.89 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4976  peptidase M22 glycoprotease  33.47 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  37.17 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  28.89 
 
 
230 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  35.24 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  28.44 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  36.22 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  29.91 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  28.44 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  39.84 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  31.06 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  26.79 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  32.38 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  39.38 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  29.39 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  42.58 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  44.12 
 
 
210 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  30.47 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  27.56 
 
 
234 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  32.6 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  32.6 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0445  peptidase M22 glycoprotease  37.21 
 
 
221 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  39.06 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2748  peptidase M22 glycoprotease  31.76 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  40.56 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  31.76 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  44.12 
 
 
210 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  42.54 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  32.85 
 
 
220 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0714  peptidase M22 glycoprotease  32.75 
 
 
216 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  43.57 
 
 
229 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  31.06 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  29.82 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  26.75 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1236  peptidase M22 glycoprotease  28.88 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  34.76 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  32.64 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1634  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  26.56 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1401  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  36.15 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  30.29 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  36.11 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  32.81 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  32.16 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0045  peptidase M22 glycoprotease  29.52 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  39.84 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  37.65 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  40.56 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  34.39 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  33.74 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1778  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  40.77 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  28.15 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2665  peptidase M22, glycoprotease  47.31 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00483372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  36.72 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  28.39 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  35 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  28.57 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4358  peptidase M22, glycoprotease  32.59 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  33.61 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.21 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  30.17 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  34.42 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  31.54 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  37.21 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  40.77 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>