259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2239 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
464 aa  917    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  32.01 
 
 
471 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 
463 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
480 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
478 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  29.71 
 
 
531 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.58 
 
 
477 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  29.9 
 
 
541 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
486 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  33.97 
 
 
459 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.37 
 
 
489 aa  177  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 
456 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  31.5 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  33.91 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 
477 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.02 
 
 
458 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  27.02 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.75 
 
 
475 aa  140  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 
458 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
627 aa  136  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  26.59 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  32.62 
 
 
549 aa  126  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
570 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  23.19 
 
 
537 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  27 
 
 
457 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 
457 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 
466 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  26.12 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 
583 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
623 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  29.33 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 
453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
642 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
432 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
432 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  23.4 
 
 
432 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 
637 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.35 
 
 
519 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  26.09 
 
 
838 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  31.37 
 
 
858 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  31.09 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  29.54 
 
 
541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.83 
 
 
475 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  28.4 
 
 
665 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  31.25 
 
 
696 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
432 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.04 
 
 
457 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 
645 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 
645 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 
858 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 
858 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 
472 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 
548 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  25.77 
 
 
818 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
560 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  32.21 
 
 
697 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
846 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  32.67 
 
 
715 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  27.06 
 
 
455 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 
440 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
631 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 
847 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 
568 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
685 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.43 
 
 
647 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
429 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 
631 aa  103  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 
462 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
683 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  26.64 
 
 
525 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  27.43 
 
 
539 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  32.26 
 
 
532 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 
629 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 
640 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
688 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
588 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  37.78 
 
 
708 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 
657 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  29.15 
 
 
653 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  27.59 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.71 
 
 
457 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.03 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  36.52 
 
 
480 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 
586 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 
644 aa  96.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 
624 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>