More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2224 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  100 
 
 		 425 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  66.12 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  64.69 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  62.12 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  64.15 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  62.8 
 
 		 437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  60.8 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  58.55 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  60.72 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  58.31 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  61.2 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  60 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  60.24 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  60.88 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.53 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  57.68 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  59.2 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  59.38 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  59.2 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  59.2 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  59.9 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  58.12 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  59.28 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  58.18 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  56.71 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  58.55 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  57.48 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  56.94 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  57.52 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  57.18 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  57.31 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  58.68 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  57.24 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  57.38 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  56.47 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  56.78 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  55.87 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  58.27 
 
 		 432 aa  504  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  57.01 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  56.14 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  54.8 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  55.01 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  54.14 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  55.61 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  54.38 
 
 		 434 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  54.93 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  55.71 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  56.18 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  54.65 
 
 		 431 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  55.63 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  55.5 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  55.01 
 
 		 430 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  54.57 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  55.24 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  54.19 
 
 		 433 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  55.4 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  55.74 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  55.98 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  55.29 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  56.07 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  54.59 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  53.86 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  54.31 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.88 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  56.76 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  54.93 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  53.52 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  56.52 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  53.36 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.08 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  55.24 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  53.41 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  55.98 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  55.4 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  52.83 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  53.88 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  55.53 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  55.56 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  54.46 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  53.61 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  54.44 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  54.69 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  52.42 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  54.93 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  53.63 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  53.65 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  54.78 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  54.18 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>