More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2148 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 167 aa  333  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 174 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 174 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 158 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.71 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  37.43 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  37.43 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  37.43 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 218 aa  90.9  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  37.43 
 
 		 222 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 222 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.05 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.73 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>