More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2142 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 700 aa  1417    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.14 
 
 		 702 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.35 
 
 		 707 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.79 
 
 		 706 aa  632  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.8 
 
 		 704 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.76 
 
 		 703 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.36 
 
 		 712 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.95 
 
 		 701 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  46.59 
 
 		 700 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.84 
 
 		 706 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.79 
 
 		 706 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.31 
 
 		 779 aa  611  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.73 
 
 		 767 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.71 
 
 		 719 aa  602  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.72 
 
 		 703 aa  597  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 		 696 aa  598  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.53 
 
 		 702 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 695 aa  596  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.11 
 
 		 698 aa  594  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.59 
 
 		 706 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.41 
 
 		 765 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.24 
 
 		 829 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.42 
 
 		 772 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.69 
 
 		 772 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.66 
 
 		 683 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.44 
 
 		 714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.6 
 
 		 694 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 		 818 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.85 
 
 		 817 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.48 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.99 
 
 		 805 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.32 
 
 		 904 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.32 
 
 		 772 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 819 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.79 
 
 		 689 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.52 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.15 
 
 		 819 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 		 778 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.48 
 
 		 685 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 		 818 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 681 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 		 827 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  41.81 
 
 		 818 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.67 
 
 		 827 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.32 
 
 		 904 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.99 
 
 		 786 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.27 
 
 		 685 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.12 
 
 		 822 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 740 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.4 
 
 		 692 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.21 
 
 		 787 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.64 
 
 		 822 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 		 832 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 781 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 691 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.96 
 
 		 776 aa  522  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 682 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.88 
 
 		 908 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.15 
 
 		 903 aa  521  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.35 
 
 		 753 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 685 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 		 682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.89 
 
 		 842 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 		 682 aa  515  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.65 
 
 		 657 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 		 776 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.76 
 
 		 815 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 681 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 846 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.78 
 
 		 815 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.63 
 
 		 680 aa  505  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 846 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 		 818 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 671 aa  502  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.44 
 
 		 818 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 842 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.7 
 
 		 812 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.23 
 
 		 678 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 686 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.5 
 
 		 818 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.52 
 
 		 846 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.03 
 
 		 763 aa  492  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 		 672 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 		 779 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 		 682 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 682 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 692 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 		 691 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 704 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 676 aa  482  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>