192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2137 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  59.86 
 
 
293 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  57.79 
 
 
290 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  55.24 
 
 
287 aa  319  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  59.51 
 
 
289 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  55.9 
 
 
289 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  56.79 
 
 
296 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  56.02 
 
 
286 aa  315  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  53.47 
 
 
289 aa  315  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  55.56 
 
 
289 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  55.21 
 
 
289 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  51.22 
 
 
289 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  55.68 
 
 
286 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  55.02 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  55.02 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  55.51 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  55.02 
 
 
286 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  56.4 
 
 
300 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  56.63 
 
 
295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  56.14 
 
 
303 aa  308  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  53.12 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  54.58 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  53.76 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  55.13 
 
 
287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  52.11 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  51.05 
 
 
285 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  52.43 
 
 
289 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  51.9 
 
 
294 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  53.57 
 
 
286 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  51.58 
 
 
300 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  54.07 
 
 
286 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  55.47 
 
 
289 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  52.33 
 
 
311 aa  298  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  53.11 
 
 
286 aa  298  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  55.11 
 
 
289 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  53.7 
 
 
286 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  55.11 
 
 
289 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  54.81 
 
 
286 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  54.81 
 
 
286 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  52.33 
 
 
300 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  54.44 
 
 
286 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  54.44 
 
 
286 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  54.44 
 
 
286 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  54.38 
 
 
289 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  55.21 
 
 
286 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  51.74 
 
 
288 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  51.76 
 
 
285 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  51.4 
 
 
294 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  52.4 
 
 
288 aa  292  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  52.6 
 
 
291 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  54.55 
 
 
287 aa  291  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  52.76 
 
 
291 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  53.33 
 
 
292 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  54.75 
 
 
287 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  56.25 
 
 
314 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  53.5 
 
 
287 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  51.46 
 
 
288 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  53.5 
 
 
287 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  51.56 
 
 
291 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  49.48 
 
 
294 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  50.53 
 
 
288 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  52.25 
 
 
299 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  50.92 
 
 
287 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  54.93 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  55.48 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  53.21 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  53.55 
 
 
286 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  54.77 
 
 
301 aa  285  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  49.63 
 
 
287 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  51.21 
 
 
293 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  50.93 
 
 
289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  52.23 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  49.47 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  53.9 
 
 
314 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  53.55 
 
 
292 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  50.55 
 
 
288 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  48.75 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  51.06 
 
 
300 aa  271  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  51.26 
 
 
310 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  51.26 
 
 
283 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  46.76 
 
 
284 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  48.25 
 
 
268 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  52.65 
 
 
277 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  50.56 
 
 
284 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0166  palmitoyl-CoA hydrolase  44.52 
 
 
297 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>