More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2133 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 760 aa  1519    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 768 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  30.55 
 
 		 699 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  28.16 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 702 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 702 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 672 aa  177  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 697 aa  170  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  30.45 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 759 aa  167  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  27.98 
 
 		 725 aa  167  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  28.11 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 699 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  26.28 
 
 		 669 aa  160  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  26.72 
 
 		 687 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 673 aa  157  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  25.67 
 
 		 710 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.11 
 
 		 684 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  26.13 
 
 		 687 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  25.72 
 
 		 723 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  25.98 
 
 		 709 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  25.91 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  27.13 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  25.87 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  26.35 
 
 		 688 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  25.58 
 
 		 688 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 681 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  25 
 
 		 686 aa  147  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  24.54 
 
 		 681 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 681 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  25.68 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  24.73 
 
 		 691 aa  146  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  25.5 
 
 		 745 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 696 aa  144  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  25.34 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  25.34 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  25.76 
 
 		 753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  26.12 
 
 		 726 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  25.04 
 
 		 745 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  25.34 
 
 		 710 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  25.04 
 
 		 745 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  25.04 
 
 		 745 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.35 
 
 		 667 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.77 
 
 		 676 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 668 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  24.08 
 
 		 663 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  26.03 
 
 		 668 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.63 
 
 		 676 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 683 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  26.2 
 
 		 724 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  25.42 
 
 		 668 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.27 
 
 		 662 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 661 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  27.15 
 
 		 687 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  24.24 
 
 		 661 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 718 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  25.23 
 
 		 667 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 741 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 684 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 735 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 793 aa  95.5  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 801 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  21.39 
 
 		 775 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 685 aa  92  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 750 aa  91.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 716 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  23.5 
 
 		 811 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 767 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 897 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 721 aa  83.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 933 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  19.61 
 
 		 780 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 758 aa  80.1  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 1089 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  21.69 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  20.99 
 
 		 665 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 769 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  21 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 814 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 922 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 742 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>