173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2098 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 76 aa  147  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.71 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  53.62 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  55.22 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  55.22 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  53.73 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  52.24 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.68 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.17 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  47.83 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  45.45 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  47.76 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.79 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.17 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.13 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  50.72 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  43.48 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.48 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  50.72 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  36.11 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  36.11 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  36.11 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.72 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.5 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  33.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.48 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2432  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.5 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.660547 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.03 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.21 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  38.89 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>