More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2095 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  55.29 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 		 272 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  54.26 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  59.14 
 
 		 263 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  56.85 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  53.12 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 436 aa  252  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  51.69 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 286 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 284 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 		 266 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.21 
 
 		 490 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 450 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  46.48 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  49.03 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  47.88 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 444 aa  229  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 		 268 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  45.7 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  45.31 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  45.31 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  45.31 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  45.31 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  52.55 
 
 		 492 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.79 
 
 		 497 aa  224  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.96 
 
 		 497 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  51.04 
 
 		 484 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 449 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 274 aa  221  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  50.21 
 
 		 484 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.72 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>