More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2052 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  100 
 
 		 828 aa  1643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  42.19 
 
 		 815 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  40.27 
 
 		 804 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  38.57 
 
 		 831 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  41.89 
 
 		 754 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  42.16 
 
 		 810 aa  558  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.71 
 
 		 815 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.87 
 
 		 815 aa  558  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  40.96 
 
 		 810 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  39.35 
 
 		 798 aa  552  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.22 
 
 		 802 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.27 
 
 		 801 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 801 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  37.39 
 
 		 801 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  37.39 
 
 		 801 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.27 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.93 
 
 		 801 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  37.32 
 
 		 801 aa  545  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  42.07 
 
 		 810 aa  545  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  37.27 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  40.56 
 
 		 811 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  39.98 
 
 		 803 aa  545  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 802 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 802 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.78 
 
 		 809 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  37.09 
 
 		 801 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  40.78 
 
 		 812 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  40.02 
 
 		 812 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  38.32 
 
 		 815 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  37.28 
 
 		 815 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.54 
 
 		 781 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  36.27 
 
 		 824 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  37.08 
 
 		 803 aa  532  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.36 
 
 		 801 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  35.53 
 
 		 815 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  37.05 
 
 		 818 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  35.31 
 
 		 832 aa  520  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  41.08 
 
 		 813 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.03 
 
 		 798 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 796 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  39.23 
 
 		 815 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  37.62 
 
 		 815 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  47.17 
 
 		 758 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  36.36 
 
 		 804 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  44.32 
 
 		 745 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.29 
 
 		 858 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  40.99 
 
 		 868 aa  502  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 817 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  40.26 
 
 		 825 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  39.41 
 
 		 835 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  39.27 
 
 		 843 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 732 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  40.29 
 
 		 835 aa  492  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  45.2 
 
 		 752 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  38.15 
 
 		 914 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  38.63 
 
 		 745 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  47.08 
 
 		 751 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  37.05 
 
 		 815 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  43.08 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  46.43 
 
 		 746 aa  486  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  47.83 
 
 		 744 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  38.04 
 
 		 848 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  40.38 
 
 		 866 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  44.87 
 
 		 752 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.62 
 
 		 802 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  46.28 
 
 		 735 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  38.24 
 
 		 849 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  44.31 
 
 		 747 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  45.6 
 
 		 738 aa  467  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  45.97 
 
 		 732 aa  469  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 770 aa  465  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.32 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  38.41 
 
 		 780 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  39.07 
 
 		 731 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 814 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  32.18 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.9 
 
 		 731 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  39.16 
 
 		 836 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  47.26 
 
 		 730 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  44.04 
 
 		 775 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  41.97 
 
 		 786 aa  452  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  41.36 
 
 		 821 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  43.12 
 
 		 768 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 731 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  38.78 
 
 		 749 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  37.87 
 
 		 829 aa  446  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  40.9 
 
 		 724 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  47.33 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  41.1 
 
 		 753 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 806 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  41.69 
 
 		 738 aa  439  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 		 732 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  44.39 
 
 		 733 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  46.32 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 715 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  42.39 
 
 		 725 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  44.57 
 
 		 739 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  36.28 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>