More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2023 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  71.26 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  68.83 
 
 		 253 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  68.11 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  68.15 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  67.74 
 
 		 252 aa  358  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  68.27 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  65.32 
 
 		 249 aa  347  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  67.07 
 
 		 254 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  64.23 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 		 246 aa  338  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  65.99 
 
 		 250 aa  338  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  67.07 
 
 		 249 aa  338  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 248 aa  337  9e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  64.92 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  66.94 
 
 		 263 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  64.34 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  64.34 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  63.6 
 
 		 256 aa  328  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  64.52 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  64.26 
 
 		 250 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  63.75 
 
 		 251 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  63.86 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 261 aa  326  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  63.71 
 
 		 249 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  61.54 
 
 		 250 aa  324  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  64.26 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  62.9 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  60.87 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  63.71 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  62.9 
 
 		 251 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  63.97 
 
 		 257 aa  321  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  62 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  59.35 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  59.35 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  63.37 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  62 
 
 		 280 aa  318  6e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  63.9 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  64.29 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.85 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  63.64 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  62.96 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  62.86 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  63.41 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  61.54 
 
 		 261 aa  316  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  60.73 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  60.91 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  61.75 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  62.14 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  60.73 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  59.92 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  64.73 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 		 261 aa  311  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  60.32 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  60.32 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  60.32 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  62.2 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  59.51 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  62.5 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  62.9 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  59.76 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  59.76 
 
 		 248 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  60.32 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  59.11 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  61.66 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  61.51 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  60.58 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  60.58 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  60.41 
 
 		 247 aa  305  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  60.58 
 
 		 250 aa  304  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  62.86 
 
 		 256 aa  304  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  57.96 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  61.45 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>