41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2018 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  330  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  34.9 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  26.81 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  37.9 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2398  hypothetical protein  36.28 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0988059  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  23.66 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1465  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1560  hypothetical protein  36.28 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0206822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1313  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  25.69 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0248  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  21.48 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  30.08 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1563  hypothetical protein  32.79 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0151315  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  22.22 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  28.47 
 
 		 341 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0579  hypothetical protein  38 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.461957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  33.62 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1306  hypothetical protein  29.31 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0193608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  25 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  33.62 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  33.62 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1246  hypothetical protein  27.87 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  25.38 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2170  hypothetical protein  26.19 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.122889  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  26.85 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0684  hypothetical protein  31.37 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.21 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  24.79 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1939  hypothetical protein  27.69 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.51 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  30.83 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  28.07 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  26.85 
 
 		 350 aa  42  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>