237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1989 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  41.99 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.44 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  38.59 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  38.83 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.01 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  35.83 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.6 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  41.61 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.06 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  45 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  41.46 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.96 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.65 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.99 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  43.68 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  35.6 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  35.6 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  45.68 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  35.6 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  39.79 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  35.08 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  35.08 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.08 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.08 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.08 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  35.08 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  38.83 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  39.27 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.15 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  39.3 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  44.38 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  39.39 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  42.55 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.67 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  57.98 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  43.5 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.43 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  40.22 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  35.43 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  42.58 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.86 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  35.84 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  38.38 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.91 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.46 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  34.19 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  37.38 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.04 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.12 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  40.11 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.73 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  39.88 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.91 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  38.12 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.76 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  40.74 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  39.27 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.76 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.54 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  42.95 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  40.24 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  36.73 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  42.69 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  37.19 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  40.19 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  38.42 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  38.02 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  36.72 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  36.67 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  34.5 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  39.39 
 
 		 290 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  43.2 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.17 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.1 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  37.63 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  47.2 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  41.92 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  39.57 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  46.72 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.76 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  36.75 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  34.81 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  38.61 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  38.01 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.69 
 
 		 233 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>