133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1975 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
272 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.33 
 
 
267 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  45.56 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  43.22 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.12 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.88 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.05 
 
 
272 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.03 
 
 
273 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.62 
 
 
272 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.64 
 
 
274 aa  208  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.39 
 
 
270 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.31 
 
 
285 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.69 
 
 
302 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.42 
 
 
283 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
274 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.79 
 
 
271 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.52 
 
 
282 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.03 
 
 
270 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.41 
 
 
272 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.3 
 
 
274 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  45.68 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.64 
 
 
274 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.76 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.88 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.39 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.07 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.58 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.54 
 
 
288 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 
275 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.7 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.53 
 
 
279 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.48 
 
 
279 aa  191  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.64 
 
 
274 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
276 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.03 
 
 
281 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.4 
 
 
275 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.12 
 
 
270 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 
278 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.7 
 
 
306 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.41 
 
 
274 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.01 
 
 
274 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
271 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  43.3 
 
 
276 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.07 
 
 
275 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.45 
 
 
284 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.3 
 
 
281 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  42.69 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.7 
 
 
264 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.54 
 
 
266 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.48 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.57 
 
 
273 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 
274 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.16 
 
 
283 aa  169  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.36 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.98 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.23 
 
 
287 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.86 
 
 
287 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.77 
 
 
311 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  35.21 
 
 
477 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  39.64 
 
 
513 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.44 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.65 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.64 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.95 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.88 
 
 
479 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.88 
 
 
479 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  40.3 
 
 
286 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  38.12 
 
 
482 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.09 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.65 
 
 
320 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.82 
 
 
500 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.96 
 
 
258 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.38 
 
 
309 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.12 
 
 
259 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  39 
 
 
308 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.87 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.34 
 
 
347 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
317 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.39 
 
 
312 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.87 
 
 
288 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.25 
 
 
286 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.47 
 
 
290 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.34 
 
 
286 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.2 
 
 
272 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.3 
 
 
278 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.58 
 
 
274 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.65 
 
 
276 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>