More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1923 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 383 aa  768    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.44 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  47.38 
 
 		 363 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  46.49 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  43.68 
 
 		 352 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  43.39 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  48.1 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  46.99 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  48.41 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.66 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  43.3 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  39.89 
 
 		 384 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.62 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.98 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.6 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  47.4 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  41.07 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 		 360 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.24 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  43.71 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.44 
 
 		 369 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  41.14 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  39.54 
 
 		 401 aa  262  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.39 
 
 		 375 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.73 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.96 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.44 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.11 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.94 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.11 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  50.65 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.88 
 
 		 353 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  43.33 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  37.09 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 615 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  40.33 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.61 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  34.7 
 
 		 374 aa  248  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  43.52 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.06 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  39.87 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.31 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  35.15 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  49.02 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  42.33 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  43.64 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0019  A/G-specific adenine glycosylase  47.7 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.33 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.1 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.27 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  36.34 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  39.77 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.2 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  47.69 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  37.06 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  40.5 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  39.49 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  45.55 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.76 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2013  A/G-specific adenine glycosylase  46.22 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  38.78 
 
 		 381 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  40.67 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.41 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>