252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1877 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  67.44 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.75 
 
 		 177 aa  240  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 		 204 aa  239  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.44 
 
 		 181 aa  239  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.2 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 		 182 aa  232  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.13 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  62.57 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 		 182 aa  231  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 182 aa  230  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 176 aa  228  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 176 aa  227  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  64.61 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 176 aa  220  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.5 
 
 		 176 aa  220  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 		 178 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 176 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 176 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 176 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 184 aa  217  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 176 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 182 aa  217  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 174 aa  215  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 176 aa  214  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 176 aa  214  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 		 180 aa  213  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 174 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 180 aa  210  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 180 aa  210  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.22 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 		 188 aa  209  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  62.43 
 
 		 176 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 180 aa  207  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 		 188 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 184 aa  207  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 176 aa  207  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>