250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1875 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.35 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  29.31 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  26.73 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.84 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 286 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 357 aa  86.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  34.87 
 
 		 315 aa  85.9  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  24.28 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.83 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  35.03 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>