216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1871 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 		 313 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.09 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.67 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.72 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.67 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  36.42 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  36.09 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.54 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  36.09 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  36.09 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  36.3 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  36.3 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  38.28 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  36.3 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  36.3 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  35.97 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  33.89 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.72 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  44.16 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  40.2 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.74 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.09 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.41 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.3 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.62 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.42 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.37 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.25 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.12 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.94 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  39.67 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.3 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.62 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  37.58 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.98 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.13 
 
 		 304 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.44 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  42.9 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.83 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.7 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.5 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.14 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  37.67 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  37.06 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.42 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.15 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.59 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  37 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.59 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  36.33 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  40.26 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.59 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  31.67 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  36.33 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  36 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  36 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  36 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  36 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.74 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.04 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.24 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  31.54 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  31.82 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.23 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.18 
 
 		 296 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  35.6 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.68 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  39.86 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.99 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.27 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.64 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  31.1 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  36.09 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  35.1 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  34.95 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  35.76 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.4 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.46 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  36.67 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.17 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  38.29 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  35.31 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  34.97 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.47 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  34.97 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  38.19 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  34.97 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  36.67 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  39.48 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>