More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1852 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  100 
 
 		 1074 aa  2170    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.95 
 
 		 1366 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  26.9 
 
 		 1280 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.49 
 
 		 976 aa  278  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  23.89 
 
 		 959 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  25.77 
 
 		 966 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 1204 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 1526 aa  227  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  27.38 
 
 		 1346 aa  227  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.66 
 
 		 1407 aa  214  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 		 691 aa  208  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 1341 aa  208  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1498 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.38 
 
 		 1093 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1181 aa  194  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  31.72 
 
 		 1175 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 646 aa  190  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  41.88 
 
 		 487 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  30.7 
 
 		 921 aa  186  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 923 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 1029 aa  184  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.96 
 
 		 565 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  30.85 
 
 		 1086 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  29.74 
 
 		 1084 aa  181  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.34 
 
 		 1340 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.66 
 
 		 1400 aa  177  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.59 
 
 		 1418 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  24.52 
 
 		 1373 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 846 aa  175  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 676 aa  175  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.29 
 
 		 1335 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1145 aa  174  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 568 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 713 aa  174  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.91 
 
 		 659 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 		 1331 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 		 982 aa  173  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  37.8 
 
 		 845 aa  172  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 849 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  41.56 
 
 		 849 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 708 aa  172  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 1038 aa  172  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  31.77 
 
 		 1185 aa  172  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  29.39 
 
 		 1311 aa  172  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  31.71 
 
 		 1298 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  38.28 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 		 1177 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  32.03 
 
 		 1343 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.47 
 
 		 835 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 785 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 662 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  36.76 
 
 		 697 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 764 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 781 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1069 aa  169  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  28.09 
 
 		 1351 aa  169  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1126 aa  169  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.8 
 
 		 948 aa  168  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  39.67 
 
 		 560 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 767 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1033 aa  167  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1131 aa  167  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 1003 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1369 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1059 aa  167  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.82 
 
 		 882 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  27.41 
 
 		 1347 aa  166  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  38.26 
 
 		 891 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1305 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 765 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 837 aa  166  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1199 aa  166  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.56 
 
 		 968 aa  166  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1310 aa  165  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 909 aa  165  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 662 aa  165  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  26.94 
 
 		 1374 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  40.09 
 
 		 868 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.91 
 
 		 926 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1362 aa  164  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.92 
 
 		 923 aa  164  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  37.61 
 
 		 576 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  40.25 
 
 		 1361 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 744 aa  164  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 858 aa  164  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 404 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.78 
 
 		 1135 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1118 aa  164  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 		 916 aa  164  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 575 aa  164  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1314 aa  164  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  37.45 
 
 		 914 aa  164  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 687 aa  164  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  20.74 
 
 		 918 aa  164  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  32.5 
 
 		 1257 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 932 aa  164  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 653 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  38.2 
 
 		 761 aa  163  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.21 
 
 		 929 aa  163  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>