67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1820 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  42.57 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  40.82 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  37.86 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  40.43 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  35.87 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  37.37 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  37.78 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  36.59 
 
 		 1230 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 318 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 566 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  29.87 
 
 		 708 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 466 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 3172 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 632 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 1104 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.55 
 
 		 725 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.68 
 
 		 764 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 632 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2536  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.949555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.14 
 
 		 624 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 697 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1154 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 949 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  35.8 
 
 		 694 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 3301 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 		 963 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 909 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.84 
 
 		 622 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 673 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 361 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  38.33 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3359  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 466 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 		 582 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  29.11 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 423 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 1028 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 522 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 522 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 		 614 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 1186 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  26.6 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  25.27 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.87 
 
 		 439 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 		 442 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 		 203 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 681 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>