More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1808 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.56 
 
 
287 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.05 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  43.21 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  41.2 
 
 
280 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  45.52 
 
 
281 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  40.83 
 
 
297 aa  185  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  39.44 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.49 
 
 
284 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.81 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.86 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  43.01 
 
 
296 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  42.35 
 
 
285 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  40.36 
 
 
280 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.59 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.15 
 
 
285 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.89 
 
 
285 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  38.31 
 
 
282 aa  175  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  44.48 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  38.26 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.89 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.93 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  44.53 
 
 
288 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  38.7 
 
 
285 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  43.37 
 
 
284 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.73 
 
 
297 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  39.55 
 
 
284 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  41.5 
 
 
288 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
287 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  34.28 
 
 
361 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.63 
 
 
282 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.87 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  41.32 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  41.79 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.13 
 
 
280 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.3 
 
 
314 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.7 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.34 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  37.01 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.52 
 
 
285 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  34.62 
 
 
285 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.46 
 
 
301 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  38.41 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  40.59 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  40.75 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  41.34 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.61 
 
 
293 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.49 
 
 
285 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  40.36 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  37.68 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.99 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.57 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  40.75 
 
 
280 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.48 
 
 
286 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.06 
 
 
289 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
280 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.57 
 
 
279 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  40.68 
 
 
288 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  39.35 
 
 
281 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
303 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  38.17 
 
 
286 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.05 
 
 
280 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  31.27 
 
 
359 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 
288 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  37.22 
 
 
284 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  40.65 
 
 
280 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  38.89 
 
 
325 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.78 
 
 
279 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  42.81 
 
 
284 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.62 
 
 
280 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  39.68 
 
 
287 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  36.27 
 
 
286 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.54 
 
 
285 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  38.87 
 
 
288 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
280 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.88 
 
 
345 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.69 
 
 
289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  39.56 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  38.55 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  43.11 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.49 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.62 
 
 
285 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  34.64 
 
 
287 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  33.33 
 
 
587 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.41 
 
 
289 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.21 
 
 
284 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  32.97 
 
 
587 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  36.73 
 
 
293 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  41 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  38.93 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  42.38 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.49 
 
 
270 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
283 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.32 
 
 
313 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  35.27 
 
 
330 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  40 
 
 
317 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.88 
 
 
304 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>