More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1795 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
330 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.57 
 
 
334 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  70.16 
 
 
320 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  67.76 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  69.61 
 
 
324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  68.37 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  67.76 
 
 
325 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  64.38 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  67.43 
 
 
323 aa  441  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.76 
 
 
322 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.95 
 
 
329 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.58 
 
 
317 aa  431  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  68.85 
 
 
320 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.9 
 
 
332 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  67.42 
 
 
322 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  63.16 
 
 
310 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  62.5 
 
 
310 aa  407  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  65.47 
 
 
329 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.44 
 
 
338 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  62.87 
 
 
348 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  60.4 
 
 
333 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  62.54 
 
 
332 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.98 
 
 
310 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  57.93 
 
 
328 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  57.7 
 
 
328 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  59.29 
 
 
312 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  58.2 
 
 
318 aa  374  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  56.44 
 
 
304 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
304 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  57.24 
 
 
304 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
304 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  57.14 
 
 
314 aa  363  3e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  56.59 
 
 
311 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  57.89 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  57.52 
 
 
323 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  55.37 
 
 
313 aa  355  5e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  55.92 
 
 
322 aa  351  8.999999999999999e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  53.27 
 
 
321 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  53.29 
 
 
319 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.9 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  50.82 
 
 
315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  50.67 
 
 
307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.97 
 
 
303 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  49.67 
 
 
308 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.83 
 
 
298 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.51 
 
 
307 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  48.53 
 
 
352 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  46.75 
 
 
304 aa  288  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.72 
 
 
341 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
331 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  47.28 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  47.28 
 
 
308 aa  286  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.68 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  48.51 
 
 
301 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.55 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  48.21 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000717846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  46.56 
 
 
308 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  47.3 
 
 
303 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  47.52 
 
 
301 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  46.69 
 
 
353 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35390  quinolinate synthetase  45.74 
 
 
352 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.25 
 
 
304 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1542  quinolinate synthetase  46.37 
 
 
352 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
306 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
352 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.25 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  46.45 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.07 
 
 
303 aa  271  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  45.25 
 
 
334 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  45.28 
 
 
304 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  49.35 
 
 
348 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  45.31 
 
 
305 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3959  quinolinate synthetase complex, subunit A  46.25 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  46.03 
 
 
304 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  44.25 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4397  quinolinate synthetase  45.93 
 
 
352 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0852  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
342 aa  268  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00075405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.36 
 
 
304 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  45.11 
 
 
355 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  43.99 
 
 
395 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2524  quinolinate synthetase  45.34 
 
 
356 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.792691  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  44.16 
 
 
353 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.17 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  43.53 
 
 
353 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.62 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
345 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  44.86 
 
 
379 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
326 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
376 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  43.02 
 
 
357 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  45.25 
 
 
304 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  43.65 
 
 
349 aa  261  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  43.81 
 
 
353 aa  261  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  44.24 
 
 
379 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.24 
 
 
348 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>