264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1792 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  47.5 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  46.27 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  44.41 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  45.45 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  46.72 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  47.25 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  47.43 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  41.48 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  42.28 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  42.07 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  42.09 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  41.04 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  42.55 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  41.24 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  39.41 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  42.75 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  40.73 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  40.73 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  35.66 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  35.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  35.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.43 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  27.2 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  27.94 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  26.41 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  29.79 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  25.68 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 320 aa  72  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.97 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  24.77 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.15 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  27.46 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.12 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>