244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1790 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  100 
 
 		 440 aa  889    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  41.88 
 
 		 455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  37.05 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  36.78 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  28.31 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  29.44 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  30.75 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  27.23 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  31.39 
 
 		 470 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  27.12 
 
 		 585 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  29.91 
 
 		 568 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 666 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.42 
 
 		 686 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  25.7 
 
 		 672 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  29.18 
 
 		 496 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.8 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  28.34 
 
 		 692 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  26.77 
 
 		 694 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.89 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  25.43 
 
 		 680 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.74 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  28.35 
 
 		 702 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.35 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  27.34 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.37 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.4 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.29 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.59 
 
 		 1066 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  26.09 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.66 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.84 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.29 
 
 		 1065 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  25.88 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.45 
 
 		 1138 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.93 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.92 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.76 
 
 		 1067 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  25.18 
 
 		 1084 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  25.05 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.32 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25.42 
 
 		 1069 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.42 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.29 
 
 		 1062 aa  93.6  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.69 
 
 		 1071 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.64 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.47 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.72 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  23.24 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.81 
 
 		 1059 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.82 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.06 
 
 		 440 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.2 
 
 		 1062 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.47 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.59 
 
 		 1005 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.61 
 
 		 1081 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.06 
 
 		 1060 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.04 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1062 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.52 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  25.35 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  22.06 
 
 		 1052 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1062 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.01 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.29 
 
 		 1062 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.71 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.12 
 
 		 1062 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  24.77 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.94 
 
 		 1111 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  23.47 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.61 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.11 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.58 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.41 
 
 		 1049 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.41 
 
 		 1062 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.73 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.97 
 
 		 1113 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.41 
 
 		 1062 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  21.86 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  25.75 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  25.81 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  25.3 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  22.94 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.74 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  23.53 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.4 
 
 		 1078 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.94 
 
 		 1062 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.84 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  25.11 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.46 
 
 		 1010 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.04 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  26.18 
 
 		 819 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  28.47 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.05 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.75 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  25.62 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  23.94 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  24.94 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  24.59 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>