More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1787 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 
326 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  36.5 
 
 
300 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  40.22 
 
 
295 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  39.05 
 
 
298 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 
297 aa  165  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 
315 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  34.63 
 
 
297 aa  155  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  38.08 
 
 
363 aa  155  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 
302 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  31.8 
 
 
300 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  41.94 
 
 
296 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  37.22 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 
298 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  36.23 
 
 
299 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  33.55 
 
 
297 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  35.87 
 
 
303 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.89 
 
 
324 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  34.25 
 
 
297 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  35.91 
 
 
302 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  37.7 
 
 
317 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 
301 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  35.37 
 
 
328 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  37.74 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  37.74 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  40.22 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  37.74 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 
323 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 
306 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  38.63 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  31.29 
 
 
300 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  38.17 
 
 
300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  35.05 
 
 
622 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  38.17 
 
 
300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 
312 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  36.63 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  34.55 
 
 
311 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  34.89 
 
 
315 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 
301 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.06 
 
 
302 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 
299 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 
300 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  34.68 
 
 
304 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 
300 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.22 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  36.68 
 
 
301 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
301 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  35.27 
 
 
312 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 
483 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  34.91 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  35.41 
 
 
306 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 
315 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  36.99 
 
 
297 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  36.79 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  38.62 
 
 
472 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  34.27 
 
 
309 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  31.95 
 
 
393 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  33.82 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  30.91 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  35.89 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.55 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 
586 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  33.82 
 
 
313 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  37.86 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>