32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1725 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 355 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.26 
 
 		 599 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.62 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  29.33 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  27.21 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3658  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.61 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  40 
 
 		 618 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.14 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.87 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.9 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.39 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.37 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.89 
 
 		 606 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.67 
 
 		 585 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.89 
 
 		 606 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.41 
 
 		 453 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.04 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.43 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.61 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  36.84 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.12 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.07 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.69 
 
 		 1074 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.77 
 
 		 1034 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.17 
 
 		 557 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  25.35 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>