175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1723 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  100 
 
 
560 aa  1118    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.94 
 
 
570 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  39.51 
 
 
573 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  40.56 
 
 
566 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  37.7 
 
 
570 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  39.93 
 
 
563 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  39.37 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  40.68 
 
 
577 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  39.2 
 
 
594 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  39.2 
 
 
578 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  42 
 
 
574 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  37.21 
 
 
557 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  39.66 
 
 
598 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  37.35 
 
 
558 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  39.03 
 
 
576 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  38.38 
 
 
577 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  36.92 
 
 
578 aa  379  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  40.21 
 
 
580 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  40.88 
 
 
578 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  40.11 
 
 
574 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  38.72 
 
 
572 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  41.15 
 
 
589 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 
576 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  36 
 
 
571 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  40.85 
 
 
562 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  40.45 
 
 
580 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  37.39 
 
 
578 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  39.19 
 
 
574 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  36.35 
 
 
557 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  40.25 
 
 
569 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  35.8 
 
 
584 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  37.02 
 
 
584 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  39.83 
 
 
574 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  35.08 
 
 
584 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  40.04 
 
 
576 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  37.02 
 
 
572 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  36.85 
 
 
573 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  37.2 
 
 
573 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  37.02 
 
 
572 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  37.02 
 
 
573 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  37.02 
 
 
572 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  37.02 
 
 
572 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  37.02 
 
 
572 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  36.55 
 
 
572 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  35.63 
 
 
580 aa  349  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  36.85 
 
 
572 aa  349  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  41.15 
 
 
592 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  39.18 
 
 
580 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  34.84 
 
 
569 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  38.56 
 
 
576 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  38.56 
 
 
576 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  36.51 
 
 
573 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  40.65 
 
 
536 aa  346  7e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  40.8 
 
 
592 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  38.04 
 
 
614 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  36.43 
 
 
574 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  36.06 
 
 
588 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  32.7 
 
 
582 aa  343  7e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  40.14 
 
 
575 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  34.56 
 
 
570 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  34.56 
 
 
570 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  37.91 
 
 
642 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  37.57 
 
 
650 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  39.93 
 
 
592 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  38.98 
 
 
543 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  38.15 
 
 
578 aa  331  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  38.03 
 
 
592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  35.15 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 
570 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  37.04 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  37.03 
 
 
532 aa  319  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  39.27 
 
 
572 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.34 
 
 
740 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  35.2 
 
 
579 aa  316  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 
583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
586 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  38.07 
 
 
589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  38.23 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  38.23 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  37.72 
 
 
592 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  34.59 
 
 
586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 
560 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  37.54 
 
 
592 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  30.62 
 
 
576 aa  298  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  33.45 
 
 
577 aa  297  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  34.96 
 
 
580 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  37.37 
 
 
591 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  37.37 
 
 
591 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  37.37 
 
 
591 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  34.08 
 
 
586 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 
562 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  50.89 
 
 
621 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  33.44 
 
 
605 aa  257  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  46.03 
 
 
650 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  43.15 
 
 
337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  39.53 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  42.44 
 
 
339 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  39.22 
 
 
356 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  40.64 
 
 
356 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  42.67 
 
 
347 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>