More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1671 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  66.31 
 
 
288 aa  391  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 
297 aa  347  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 
297 aa  345  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 
285 aa  340  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  59.49 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  59.49 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  59.49 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  58.39 
 
 
277 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  58.55 
 
 
279 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  58.18 
 
 
281 aa  332  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  57.39 
 
 
297 aa  332  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  58.91 
 
 
281 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  59.27 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  59.27 
 
 
279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  58.55 
 
 
281 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  58.18 
 
 
277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  57.82 
 
 
283 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  57.82 
 
 
286 aa  324  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  57.82 
 
 
279 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  57.09 
 
 
279 aa  321  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  57.82 
 
 
277 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  56.51 
 
 
321 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  57.82 
 
 
279 aa  319  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  56.93 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  56.73 
 
 
277 aa  317  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  56.73 
 
 
277 aa  317  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  56.57 
 
 
287 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  56.88 
 
 
275 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  56.67 
 
 
355 aa  316  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  56.3 
 
 
340 aa  315  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  54.74 
 
 
282 aa  315  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  58.55 
 
 
279 aa  314  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  57.45 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  55.47 
 
 
282 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  56.73 
 
 
275 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  55.52 
 
 
296 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  54.87 
 
 
286 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  55.8 
 
 
281 aa  310  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  54.84 
 
 
285 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  55 
 
 
289 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  54.9 
 
 
293 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  54.9 
 
 
293 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  54.74 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  56.16 
 
 
277 aa  304  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  52.04 
 
 
308 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  55.07 
 
 
277 aa  299  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  52.11 
 
 
290 aa  298  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  55.76 
 
 
282 aa  297  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  51.05 
 
 
296 aa  288  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  52.23 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  51.96 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  51.62 
 
 
291 aa  285  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  53.02 
 
 
297 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  51.55 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  52.55 
 
 
301 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  52.54 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  52.67 
 
 
305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  50.53 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  50.18 
 
 
297 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  49.82 
 
 
303 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 
312 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  48.75 
 
 
289 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 
305 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  47.62 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  47.62 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  49.65 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  47.62 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  47.62 
 
 
304 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 
297 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  44.93 
 
 
277 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  43.32 
 
 
366 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 
282 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 
273 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
283 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 
291 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  35.91 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  32.7 
 
 
270 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.56 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.27 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.16 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.8 
 
 
289 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.94 
 
 
291 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.38 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 
314 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  30.18 
 
 
321 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 
288 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  30.18 
 
 
321 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.74 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.68 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  29.93 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  34.33 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  34.42 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  34.35 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  33.67 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  32.01 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>